MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 3082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	CAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002179	AAC	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002179	AGA	3	9	125	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002179	AT	4	8	157	164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002179	GAA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002179	A	6	6	1214	1219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002179	TTCA	2	8	2667	2674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002179	CAT	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002179	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002179	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002179	CAA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002179	TTG	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002179	A	6	6	5476	5481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002179	AATC	2	8	5503	5510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002179	T	6	6	15670	15675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002179	ATCT	2	8	15678	15685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002179	T	7	7	15739	15745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002179	TGT	2	6	15871	15876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002179	TTC	2	6	16611	16616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002179	GAA	2	6	16645	16650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002179	AAT	2	6	17665	17670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002179	TTTTAT	2	12	17738	17749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002179	GAT	2	6	17818	17823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002179	T	8	8	18540	18547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002179	AGA	2	6	18554	18559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002179	A	6	6	18593	18598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002179	GCT	2	6	19546	19551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002179	TAA	3	9	19587	19595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002179	AAT	2	6	19666	19671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002179	A	6	6	19676	19681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002179	ATC	2	6	19695	19700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002179	AAG	2	6	19720	19725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002179	TA	3	6	19739	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002179	A	6	6	19746	19751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002179	GCT	2	6	19752	19757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002179	CTT	2	6	19792	19797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002179	TGTT	2	8	21626	21633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002179	CTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002179	TCT	2	6	21686	21691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002179	TAA	2	6	23003	23008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002179	ATTA	2	8	23030	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002179	T	9	9	23049	23057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002179	T	6	6	23059	23064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002179	ATA	2	6	23065	23070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002179	TAT	2	6	23086	23091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002179	T	6	6	23091	23096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002179	GA	3	6	25082	25087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002179	TTA	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002179	TTG	2	6	25112	25117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002179	AC	3	6	25129	25134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002179	AATA	2	8	25148	25155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002179	CTT	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002179	T	6	6	25230	25235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002179	TGAT	2	8	25251	25258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002179	CAG	2	6	25278	25283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002179	TTCT	2	8	25295	25302	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002179	GAA	2	6	25342	25347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002179	ATAA	2	8	28011	28018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002179	TATTTT	2	12	28019	28030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002179	TTTGT	2	10	28041	28050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002179	T	7	7	28050	28056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002179	A	6	6	28075	28080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002179	T	6	6	28131	28136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002179	A	7	7	28142	28148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002179	TTAATG	2	12	28156	28167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002179	TTAA	2	8	28168	28175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002179	A	6	6	28243	28248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002179	CT	4	8	28249	28256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002179	A	7	7	30740	30746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002179	AGG	2	6	34009	34014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002179	TA	3	6	34029	34034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002179	AAG	2	6	34042	34047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002179	T	6	6	34086	34091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002179	ATT	2	6	34262	34267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002179	T	6	6	34266	34271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002179	A	6	6	34623	34628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002179	TAAT	2	8	34642	34649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002179	AAAT	2	8	34666	34673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002179	CTTT	2	8	35681	35688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002179	GAAA	2	8	35732	35739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002179	AAT	2	6	35780	35785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002179	CAT	3	9	35867	35875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002179	T	6	6	35949	35954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002179	TAC	2	6	36576	36581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002179	TTA	2	6	36641	36646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002179	T	6	6	36655	36660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002179	T	6	6	36673	36678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002179	TTG	2	6	39936	39941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002179	AAG	2	6	39949	39954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002179	ATCC	2	8	40103	40110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002179	GAG	2	6	40154	40159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002179	GAA	2	6	40201	40206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002179	GCCT	2	8	40233	40240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002179	ATT	2	6	40364	40369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002179	ATT	2	6	41624	41629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002179	TTTTTA	2	12	41735	41746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002179	GAA	2	6	41777	41782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002179	TGC	2	6	41839	41844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002179	ATTA	2	8	44821	44828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002179	GA	3	6	45110	45115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002179	AG	4	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002179	T	7	7	45865	45871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002179	AGT	2	6	47888	47893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002179	TA	3	6	54660	54665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002179	GAT	2	6	54675	54680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002179	CCG	2	6	54686	54691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_002179	AAG	2	6	54732	54737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002179	T	6	6	54775	54780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002179	GTC	2	6	54847	54852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002179	TC	3	6	54875	54880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002179	AT	3	6	54888	54893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002179	T	8	8	56548	56555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002179	TC	3	6	56784	56789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002179	CT	3	6	56808	56813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002179	A	6	6	56820	56825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002179	GAAAA	2	10	56834	56843	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002179	TTA	2	6	58128	58133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002179	AAC	2	6	59847	59852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002179	AAAG	2	8	59895	59902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002179	TAG	2	6	59990	59995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002179	TAA	2	6	59998	60003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002179	AAT	2	6	60059	60064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002179	TGATG	2	10	60075	60084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002179	G	7	7	60092	60098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002179	AAG	2	6	60120	60125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002179	GAG	2	6	60173	60178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002179	TTTA	2	8	61396	61403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002179	ACG	2	6	61434	61439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002179	TTA	2	6	61556	61561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002179	AAG	2	6	61575	61580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002179	T	6	6	61647	61652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002179	TA	5	10	61668	61677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002179	CTC	2	6	61700	61705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_002179	T	7	7	61738	61744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002179	TTTATT	2	12	61746	61757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002179	TCT	2	6	61828	61833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002179	TTC	2	6	61861	61866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002179	CTT	2	6	61879	61884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002179	TAT	2	6	61887	61892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002179	AAT	2	6	61917	61922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002179	ATA	2	6	61967	61972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002179	CTC	2	6	65275	65280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_002179	A	6	6	66357	66362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002179	AGA	2	6	66407	66412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002179	T	6	6	66419	66424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002179	TTCT	2	8	66513	66520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_002179	TCT	2	6	66525	66530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002179	CTT	2	6	66563	66568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002179	A	6	6	66579	66584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002179	TG	3	6	66590	66595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_002179	A	6	6	81103	81108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_002179	AG	3	6	210062	210067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_002179	T	6	6	223878	223883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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